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搜索教程內(nèi)容
教程列表27條
【2019-03-23】教程(五)過渡態(tài)搜索(二)
(一)引言:
? 過渡態(tài)搜索是計算化學中一個很重要的內(nèi)容,它研究化學反應的動力學方面的信息。過渡態(tài)搜索將分為多個部分進行介紹,本文作為第二部分將給初學者介紹另外一種過渡態(tài)尋找方法(Opt=TS)。
? 在第一部分內(nèi)容中我們講到,Gaussian 16中提供3種找過渡態(tài)的方法,對應關鍵詞分別為TS (需要猜測過渡態(tài)結(jié)構(gòu)), QST2(需要輸入反應物和產(chǎn)物結(jié)構(gòu)), QST3(需要輸入反應物
【2019-03-10】教程(四)GMMX構(gòu)象搜索模塊安裝
(一)引言:
? GaussView 6 可以使用新增GMMX模塊進行構(gòu)象搜索。
? 一旦GMMX 搜索完成,所有的構(gòu)象信息將會列出,你可以使用GaussView 6以單個分子組形式打開和查看。同樣,你可以查看這些構(gòu)象的能量。對于大部分研究者來說這是一個非常重要的功能。
? 本文主要講解如何將GMMX內(nèi)置于GaussView 6中
(二)安裝過程:
【2019-03-07】教程(三)利用大小基組方法加速過渡態(tài)尋找
(一)引言:
? 在過渡態(tài)結(jié)構(gòu)優(yōu)化時,如果體系比較大,在大基組情況下則需要消耗較多的計算資源及時間,特別是某些過渡態(tài)用opt=(calcfc,ts, noeigentest)或opt=(calcfc,qst2, noeigentest)方法很難找到的情況下,如何尋找過渡態(tài)以及如何有效加速過渡態(tài)尋找是研究者經(jīng)常遇到的問題。本文以1,2-丙二醇體系脫水形成環(huán)氧丙烷反應為例,提供一種有效、可行
【2019-02-13】教程(二)過渡態(tài)搜索(一)
(一)引言:
? 過渡態(tài)搜索是計算化學中一個很重要的內(nèi)容,它研究化學反應的動力學方面的信息。過渡態(tài)搜索將分為多個部分進行介紹,本文作為第一部分將為初學者介紹一種切實可行的過渡態(tài)搜索方法。
? Gaussian 16中提供3種找過渡態(tài)的方法,對應關鍵詞分別為TS (需要猜測過渡態(tài)結(jié)構(gòu)), QST2(需要輸入反應物和產(chǎn)物結(jié)構(gòu)), QST3(需要輸入反應物,產(chǎn)物結(jié)構(gòu)和過渡態(tài)結(jié)構(gòu))。 對于
【2018-12-28】教程(一)弱相互作用能計算中基組重疊誤差(BSSE)的校正
(一)引言:
在計算弱相互作用體系時,論文中一般要求加入BSSE校正,本文將以H2O和NH3分子為例介紹如何計算BSSE校正能量。
(二)計算過程:
1. 復合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率分析
█軟件:Gaussian 16, GaussView 6
█本文使用方法為M06-2X/6-311+G(d,p) 基組,并加入色散校正項。
█優(yōu)化結(jié)束后,進行頻率分
【2014-04-03】關于TDDFT的一些背景知識和使用技巧(第二講)
線性響應TDDFT通過一系列數(shù)學變換,最終可以得到一個線性本征方程(Linear Eigenequation)。
這個方程里面,A和B是從哈密頓算符(Hamiltonian)在基函數(shù)里面的表征,跟體系基態(tài)的分子軌道緊密相連。X和Y可以看做是電子往上和往下躍遷的振幅,ω就是躍遷的頻率,也就是激發(fā)態(tài)和基態(tài)的能量差 。這個方程跟CIS相比,多了B這項,同時也多了Y這一本征向量。
【2014-03-19】關于TDDFT的一些背景知識和使用技巧(第一講)
TDDFT是密度泛函的含時薛定諤方程。含時薛定諤通常以時間(Time)或者頻率(Frequency)來表征其方程解。兩種解的對應關系可以從傅立葉(Fourier)變換得到。以頻率做TDDFT的方程解的時候,得到的頻率就是分子的激發(fā)能。在頻率自由度上解析TDDFT的時候,又有很多種方法。絕大部分的方法是對TDDFT進行一階近似,也就是常說的線性響應TDDFT(Linear Response TDDF
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